Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL3A8MV65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGLL3A8MV65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGLL3A8MV65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGLL3A8MV65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL3A8MV65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL3A8MV65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGLL3A8MV65 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL3A8MV65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL3A8MV65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL3A8MV65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL3A8MV65 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VGLL3A8MV65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VGLL3A8MV65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VGLL3A8MV65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VGLL3A8MV65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VGLL3A8MV65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL3A8MV65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VGLL3A8MV65 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL3A8MV65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL3A8MV65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL3A8MV65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL3A8MV65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL3A8MV65 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL3A8MV65 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL3A8MV65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL3A8MV65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL3A8MV65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL3A8MV65 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL3A8MV65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGLL3A8MV65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL3A8MV65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL3A8MV65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGLL3A8MV65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL3A8MV65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL3A8MV65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGLL3A8MV65 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGLL3A8MV65 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGLL3A8MV65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL3A8MV65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGLL3A8MV65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGLL3A8MV65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGLL3A8MV65 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VGLL3A8MV65 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGLL3A8MV65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VGLL3A8MV65 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VGLL3A8MV65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VGLL3A8MV65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VGLL3A8MV65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGLL3A8MV65 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VGLL3A8MV65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VGLL3A8MV65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL3A8MV65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL3A8MV65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL3A8MV65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VGLL3A8MV65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms