Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF839A8K0R7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF839A8K0R7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF839A8K0R7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF839A8K0R7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF839A8K0R7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF839A8K0R7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF839A8K0R7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF839A8K0R7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF839A8K0R7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF839A8K0R7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF839A8K0R7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF839A8K0R7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF839A8K0R7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF839A8K0R7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF839A8K0R7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF839A8K0R7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF839A8K0R7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF839A8K0R7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF839A8K0R7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF839A8K0R7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF839A8K0R7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF839A8K0R7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF839A8K0R7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZNF839A8K0R7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF839A8K0R7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF839A8K0R7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF839A8K0R7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF839A8K0R7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF839A8K0R7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF839A8K0R7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF839A8K0R7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF839A8K0R7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF839A8K0R7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF839A8K0R7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF839A8K0R7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF839A8K0R7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF839A8K0R7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms