Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A6NL46 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NL46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A6NL46 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A6NL46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A6NL46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A6NL46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A6NL46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
A6NL46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A6NL46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A6NL46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NL46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A6NL46 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A6NL46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A6NL46 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A6NL46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A6NL46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A6NL46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A6NL46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A6NL46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A6NL46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A6NL46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A6NL46 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A6NL46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NL46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NL46 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NL46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NL46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A6NL46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NL46 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A6NL46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A6NL46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A6NL46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NL46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NL46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A6NL46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A6NL46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
A6NL46 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A6NL46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A6NL46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A6NL46 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A6NL46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A6NL46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A6NL46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A6NL46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A6NL46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A6NL46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A6NL46 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A6NL46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A6NL46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A6NL46 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A6NL46 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A6NL46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A6NL46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A6NL46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A6NL46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A6NL46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
A6NL46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A6NL46 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A6NL46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A6NL46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A6NL46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A6NL46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
A6NL46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A6NL46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A6NL46 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A6NL46 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A6NL46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A6NL46 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A6NL46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A6NL46 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A6NL46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A6NL46 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A6NL46 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
A6NL46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A6NL46 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A6NL46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A6NL46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A6NL46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A6NL46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
A6NL46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A6NL46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A6NL46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A6NL46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A6NL46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A6NL46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A6NL46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A6NL46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A6NL46 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A6NL46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A6NL46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A6NL46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
A6NL46 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A6NL46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A6NL46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A6NL46 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A6NL46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A6NL46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A6NL46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A6NL46 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms