Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP5A6NIR3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP5A6NIR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP5A6NIR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP5A6NIR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP5A6NIR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP5A6NIR3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP5A6NIR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP5A6NIR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AGAP5A6NIR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP5A6NIR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP5A6NIR3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP5A6NIR3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AGAP5A6NIR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP5A6NIR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP5A6NIR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP5A6NIR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP5A6NIR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP5A6NIR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP5A6NIR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP5A6NIR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP5A6NIR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP5A6NIR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP5A6NIR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP5A6NIR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP5A6NIR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms