Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC160A6NGH7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC160A6NGH7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC160A6NGH7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC160A6NGH7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC160A6NGH7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC160A6NGH7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC160A6NGH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC160A6NGH7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC160A6NGH7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC160A6NGH7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC160A6NGH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC160A6NGH7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC160A6NGH7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC160A6NGH7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC160A6NGH7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC160A6NGH7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC160A6NGH7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC160A6NGH7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC160A6NGH7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC160A6NGH7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC160A6NGH7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC160A6NGH7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC160A6NGH7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC160A6NGH7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC160A6NGH7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC160A6NGH7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC160A6NGH7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC160A6NGH7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC160A6NGH7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC160A6NGH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC160A6NGH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC160A6NGH7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC160A6NGH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC160A6NGH7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC160A6NGH7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC160A6NGH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms