Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms