Protein–RNA interactions for Protein: A5LHX3

PSMB11, Proteasome subunit beta type-11, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB11A5LHX3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB11A5LHX3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB11A5LHX3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMB11A5LHX3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB11A5LHX3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB11A5LHX3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMB11A5LHX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB11A5LHX3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB11A5LHX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB11A5LHX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB11A5LHX3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB11A5LHX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB11A5LHX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB11A5LHX3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB11A5LHX3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms