Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV24-1A0A075B6N3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV24-1A0A075B6N3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV24-1A0A075B6N3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV24-1A0A075B6N3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV24-1A0A075B6N3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV24-1A0A075B6N3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV24-1A0A075B6N3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV24-1A0A075B6N3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV24-1A0A075B6N3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV24-1A0A075B6N3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV24-1A0A075B6N3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV24-1A0A075B6N3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBV24-1A0A075B6N3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV24-1A0A075B6N3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRBV24-1A0A075B6N3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV24-1A0A075B6N3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV24-1A0A075B6N3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV24-1A0A075B6N3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV24-1A0A075B6N3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV24-1A0A075B6N3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV24-1A0A075B6N3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV24-1A0A075B6N3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV24-1A0A075B6N3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV24-1A0A075B6N3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV24-1A0A075B6N3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV24-1A0A075B6N3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms