Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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