Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1Q9UJ41 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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