Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBQLN2Q9UHD9 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBQLN2Q9UHD9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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