Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN6Q9NWW5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms