Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms