Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms