Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms