Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms