Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms