Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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USP9XQ93008 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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USP9XQ93008 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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USP9XQ93008 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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