Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms