Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL4L1Q8NHW4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms