Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms