Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASSF3Q86WH2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RASSF3Q86WH2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms