Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PXDC1Q5TGL8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms