Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms