Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TAF1AQ15573 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TAF1AQ15573 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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