Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SS18Q15532 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SS18Q15532 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms