Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RYR3Q15413 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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