Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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