Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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