Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CBX3Q13185 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CBX3Q13185 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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