Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH17Q12864 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH17Q12864 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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