Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms