Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms