Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms