Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL1Q00532 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKL1Q00532 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms