Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms