Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms