Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAD23AP54725 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms