Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC11A2P49281 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC11A2P49281 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC11A2P49281 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC11A2P49281 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms