Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRATP43155 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRATP43155 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRATP43155 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms