Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCR7P32248 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCR7P32248 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCR7P32248 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR7P32248 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms