Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGAM1P18669 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms