Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms