Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF1P05230 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF1P05230 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF1P05230 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF1P05230 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF1P05230 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF1P05230 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms