Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TOP3BO95985 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms