Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CCDC179H3BU77 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms