Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
B4DXG7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
B4DXG7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
B4DXG7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
B4DXG7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
B4DXG7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
B4DXG7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
B4DXG7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms