Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF839A8K0R7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms