Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms