Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCAF1Q9Y4C2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCAF1Q9Y4C2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms